Mikrodelecje sąsiadujących genów na chromosomie powodują szereg bardzo rzadkich zespołów (Prader-Willi, Miller-Dicker, Di-Georgie, itp.). Rozpoznanie tych zespołów stało się możliwe dzięki ulepszeniu metody otrzymywania preparatów chromosomowych. W przypadku, gdy nie można wykryć mikrodelecji poprzez kariotypowanie, stosuje się sondy DNA specyficzne dla regionu, który został poddany delecji.