Najczęstszym wskazaniem do przeszczepu rogówki - jest pemfigoid keratopatia (rzekomą, dystrofia śródbłonka Fuchs afakicheskaya), stożek rogówki, operacja ponownego przeszczepu rogówki (wirusowe, bakteryjne, grzybicze, z Acanthamoeba, perforacja) i dystrofię zrębu rogówki.