Leczenie choroby afektywnej dwubiegunowej odbywa się głównie za pomocą leków normotymicznych („stabilizatorów afektu”), takich jak lit, karbamazepina lub kwas walproinowy. Czasami jednak sięga się także po stosunkowo nowe leki: olanzapinę, risperidon, lamotryginę, gabapentynę, antagonistów wapnia.