Komórki macierzyste układu krwiotwórczego (HSC), podobnie jak komórki progenitorowe układu mezenchymalnego, charakteryzują się multipotencjalnością i dają początek liniom komórkowym, których elementy końcowe tworzą elementy krwi, a także szereg wyspecjalizowanych komórek tkankowych układu odpornościowego.