Genom HCV zawiera dodatnio naładowany jednoniciowego RNA, który koduje strukturalny (3 białko rdzeniowe nukleokapsydu i nukleoproteiny E1-E2) i 5 obwiednię strukturalne (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) białek. Każde z tych białek syntetyzowanych przeciwciał znajduje się we krwi pacjentów z zapaleniem wątroby typu C.