MRI ocenia stan struktur mózgowych na podstawie ich zarysów, rozmiarów i gęstości tkanek. Ważne jest, aby pamiętać, że MRI odzwierciedla gęstość tkanek w zależności od ich zawartości wody, a zatem przede wszystkim identyfikuje takie zmiany jak obrzęk mózgu (CED), choroby demielinizacyjne i guzy.