Okres inkubacji zapalenia wątroby typu B trwa 60-180 dni, zwykle 2-4 miesiące, w rzadkich przypadkach skraca się do 30-45 dni lub wydłuża się do 225 dni. Czas trwania okresu inkubacji zależy od dawki zakaźnej i wieku dzieci. Gdy masowe zakażenie (transfuzji krwi lub osocza), okres inkubacji jest krótka - 1,5-2 miesięcy, podczas gdy w przypadku manipulacji, pozajelitowego (podskórnego i domięśniowego wstrzyknięcia), a zwłaszcza na zakażenie domowego okresie inkubacji 4-6 miesięcy.