Powikłania z dróg żółciowych po transplantacji wątroby rozwijają się w 10-20% przypadków. Należą do nich zwężenia, przepływ żółci, przetoka i zapalenie dróg żółciowych. Może być zespolenia zwężenia powodu błędów technicznych, z powodu wygaśnięcia zapalenia dróg żółciowych i zwłóknienia i zwężenia, braku zespolenia zespolenia utworzonej powyżej bramy w kierunku wątroby spowodowane w niektórych kanałach przypadki niedokrwienia.