Powikłania dróg żółciowych po przeszczepie wątroby rozwijają się w 10-20% przypadków. Należą do nich zwężenia, wyciek żółci, przetoki i zapalenie dróg żółciowych. Mogą być obserwowane zwężenia zespoleń spowodowane błędami technicznymi, stany zapalne spowodowane wyciekiem żółci i włóknieniem oraz zwężenia niezwiązane z zespoleniami, utworzone powyżej zespolenia w kierunku wrót wątroby, spowodowane w niektórych przypadkach niedokrwieniem przewodu.