Analiza EEG jest wykonywana podczas nagrywania i ostatecznie po jego zakończeniu. Podczas nagrywania oceniana jest obecność artefaktów (indukcja pól prądu sieciowego, mechaniczne artefakty ruchu elektrod, elektromiogram, elektrokardiogram itp.) i podejmowane są działania w celu ich wyeliminowania. Oceniana jest częstotliwość i amplituda EEG, identyfikowane są charakterystyczne elementy graficzne oraz określany jest ich rozkład przestrzenny i czasowy.