Najczęściej rzekomobłoniaste zapalenie jelita grubego rozwija się pod wpływem przedłużonego stosowania antybiotyków ampicyliny, linkomycyna, Klinda-mitsina, cefalosporyny, co najmniej - penicyliny, erytromycynę, chloramfenikol, tetracykliny. Clostridium difficile - zarodniki tworzące beztlenowe Gram-dodatnie Bacillus, która jest zdolna do wytworzenia dwóch typów egzotoksyny toksyny A i toksyny B z czterech głównych przyczyn rozwoju rzekomobłoniastego zapalenia jelita grubego związane z C. Difficile.