Pacjenci zaniepokojeni tymi objawami kleszczowe zapalenie mózgu mogą obejmować ból głowy, osłabienie, złe samopoczucie, dreszcze, uderzenia gorąca, pocenie się, zawroty głowy, bóle gałek ocznych, światłowstręt, utrata apetytu, bóle mięśni, kości, kręgosłupa, w górnych i dolnych , w dolnej części pleców, w szyi i stawach.