W przypadku gruźlicy pierwotnej zmiany chorobowe są zwykle zlokalizowane w węzłach chłonnych, płucach, opłucnej, a czasami w innych narządach: nerkach, stawach, kościach, otrzewnej. Obszar określonego stanu zapalnego może być bardzo mały i pozostać ukryty podczas badania. Jeśli zmiana chorobowa jest duża, jest ona zwykle wykrywana podczas badania klinicznego i radiologicznego pacjenta.