W pierwotnej gruźlicy zmiany chorobowe są zwykle zlokalizowane w węzłach chłonnych, płucach, opłucnej, a czasami w innych narządach: nerkach, stawach, kościach, otrzewnej. Strefa określonego stanu zapalnego może być bardzo mała i pozostać ukryta podczas badania. Z dużą ilością uszkodzeń, zwykle znajduje się podczas badań klinicznych i radiologicznych pacjenta.