Diagnoza kliniczna jest wiarygodny tylko z płatowe zapalenie płuc, ale szansa na pneumokokowej etiologii pozaszpitalnego zapalenia płuc, zapalenie ucha środkowego, zapalenie zatok jest około 60-80 °. Weryfikacji diagnoza może być oparte na wynikach badań mikrobiologicznych odpowiadających biosubstrate: nieżyt nosa - wysięk z nosa (skok), z ucha środkowego, zapalenie zatok - wysięk ropny, zapalenie płuc, zapalenie opon - plwociny - płyn mózgowo-rdzeniowy.