Stwardnienie guzowate jest chorobą dziedziczną charakteryzującą się hiperplazją pochodnych ekto- i mezodermy. Wzór dziedziczenia jest autosomalny dominujący. Zmutowane geny znajdują się w loci 16p13 i 9q34 i kodują tuberyny, białka regulujące aktywność fazy GT innych białek pozakomórkowych.