Alkoimmunologiczna lub izoimmunologiczna neutropenia u noworodków występuje u płodu z powodu antygenowej niezgodności neutrofilów płodu i matki. Izoprzeciwciała matki należą do klasy IgG, przenikają przez barierę łożyskową i niszczą neutrofile dziecka. Isoantibodies są zwykle leukoaglutyniny, reagują z komórkami pacjenta i jego ojca, nie reagują z komórkami matki.