Obraz kliniczny escherichiozy jest podobny do obrazu klinicznego innych zakażeń biegunkowych. Dlatego rozpoznanie potwierdza się na podstawie badania bakteriologicznego. Materiał (kał, wymioty, płukanie żołądka, krew, mocz, płyn mózgowo-rdzeniowy, żółć) należy pobrać w pierwszych dniach choroby, zanim pacjentowi zostanie przepisane leczenie etiotropowe.