Możliwe przyczyny uszkodzenia nerwu trzeciego: polineuropatia i mononeuropatia (cukrzyca itp.), tętniaki, guzy, gruźlica, zawał mózgu, zapalenie mózgu, choroby demielinizacyjne, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, uraz, naruszenie płata skroniowego w otworze namiotu móżdżku, zespół Tolosy-Hunta, zakrzepica zatoki, przetoka szyjno-jamista